【佳學(xué)基因-基因檢測(cè)】目標(biāo)序列捕獲技術(shù)簡介

目標(biāo)序列捕獲技術(shù)是通過定制目標(biāo)基因組區(qū)域的探針，與基因組DNA進(jìn)行雜交，將目標(biāo)區(qū)域DNA富集后進(jìn)行高通量測(cè)序的技術(shù)手段。
 

在進(jìn)行外顯子組測(cè)序時(shí)，大約85%的致病突變發(fā)生在蛋白編碼區(qū)，為了正確找到并富集所要檢測(cè)的外顯子序列，就要采用序列捕獲技術(shù)，對(duì)研究已知基因的單核苷酸多態(tài)性和小片段插入/缺失突變檢測(cè)等具有較大的優(yōu)勢(shì)。
 

在人的染色體上有許多與外顯子有同源性的部分，這些有同源性的部分很可能在雜交過程中也被捕獲下來。因此，測(cè)到的序列中，有一部分不是外顯子序列。所以捕獲效率是重點(diǎn)，它的定義則是把測(cè)序得到的外顯子部分占全部測(cè)序序列的比列，目前的技術(shù)手段還不能使捕獲效率達(dá)到100% 。
 

目標(biāo)序列捕獲技術(shù)針對(duì)目的基因組區(qū)域進(jìn)行遺傳變異位點(diǎn)檢測(cè)，以及對(duì)特定區(qū)域深入研究，得到更深的覆蓋度和更高的數(shù)據(jù)正確性有很大幫助，不僅提高了對(duì)稀有變異的檢測(cè)能力，同時(shí)更經(jīng)濟(jì)有效，通量更高，適合大樣本量的研究。
 

目前其主要方法有傳統(tǒng)PCR、固相雜交法及液相雜交法。
 

PCR反應(yīng)需要合成引物，費(fèi)用很高， 且實(shí)驗(yàn)周期長、人力資源耗費(fèi)大。而新一代測(cè)序需要對(duì)大量外顯子進(jìn)行測(cè)序， 進(jìn)而研究疾病相關(guān)區(qū)域并進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性驗(yàn)證， 傳統(tǒng)的方法不能滿足這一要求。
 

固相雜交法原理則是將探針固定在芯片上，主要是利用雜交和DNA微陣列技術(shù)基因分離原理來捕獲目標(biāo)區(qū)域。將打斷后的基因組DNA與定制的序列捕獲芯片進(jìn)行雜交， 洗去未雜交上的片段， 隨后將富集的目標(biāo)片段洗脫擴(kuò)增， 賊后進(jìn)行高通量測(cè)序。該方法具有高特異性和高覆蓋度、捕獲區(qū)域可按需設(shè)計(jì)、省時(shí)省力等優(yōu)點(diǎn)。
 

液相雜交法則是在液體里雜交，通過鏈霉親和素磁珠捕獲標(biāo)記生物素的雜交探針，基于液相序列捕獲的高通量平行靶向測(cè)序技術(shù)具有高度特異性、高正確性、良好的重現(xiàn)性和廣泛的應(yīng)用前景。