【佳學基因檢測】不尋常兒童皮質性白內障可遺傳的致病基因位點基因檢測
白內障基因檢測位點的尋找與驗證
根據如何為白內障基因檢測增加更多有臨床意義的位點?,國際有很高知名度基因檢測科學性證據雜志《Invest Ophthalmol Vis Sci》在第.?2022 Jun 1;63(6):25.期發(fā)表了一篇標題為《不尋常兒童皮質性白內障可遺傳的致病基因位點基因檢測》的基因檢測在白內內障預防中的作用與意義文章。該基因領域的臨床應用研究由Terri L Young,?Kristina N Whisenhunt,?Sarah M LaMartina,?Alex W Hewitt??,?David A Mackey??,?Stuart W Tompson?完成。
基因信息數據庫索引號:
基因大數據表簽:?35749127和?doi: 10.1167/iovs.63.6.25.
基因解碼研究關鍵詞:
多點連鎖,多點單倍型,全基因組測序,兒童皮質性白內障,遺傳學基礎
國際基因解碼證據鏈條標簽:
Multipoint linkage, Multipoint haplotyping, Whole-genome sequencing,pediatric cortical cataract,genetic basis
基因檢測臨床研究與應用結果介紹:
復雜多樣的白內障的基因檢測研究目的:在一個具有不同臨床表現的白內障的大家族中,確定一種罕見的兒童皮質性白內障的遺傳基礎,明確致病基因,該白內障表現為常染色體顯性遺傳。常見眼科疾病白內障的患者特異性的遺傳基礎的研究方法:使用NimbleGen SeqCap EZ外顯子組V3試劑盒和HiSeq 2500對四名患者的DNA進行外顯子組測序,并使用基因解碼分析法進行分析。使用人類OmniExpress-24串珠芯片對12名患者和4名未受影響個體的DNA進行基因分型。進行多點連鎖和單倍型分析(Superlink-online SNP)。在HiSeq X-Ten系統上對一名先證者及其未受影響父親的DNA進行了全基因組測序。在疾病相關區(qū)域(Golden Helix SVS)中發(fā)現了罕見的小插入/缺失和單核苷酸變異(SNV)。聯合注釋相關消耗(CADD)分析預測變異的有害性。使用雙Glo熒光素酶測定系統測定假定的增強子功能和變異效應。具有遺傳變異多樣性的白內障的基因突變序列研究結果:連鎖作圖在染色體7q36上確定了6.23-centimorgan支持區(qū)間。共分離單倍型將關鍵區(qū)域細化為6.03 Mbp,包含21個蛋白質編碼基因。全基因組測序發(fā)現114個非編碼變體,CADD預測其中一個是高度有害的,這是聲波刺猬信號分子(SHH)基因內含子1內的一個新替代突變。ENCODE數據表明,該位點是一種假定的增強子,隨后通過熒光素酶報告子分析和變體相關基因過度表達證實。白內障患者基因序列多孫性的研究結論:在一個大家族中,白內障的致病基因鑒定基因解碼課題組發(fā)現了一個SHH內含子基因突變,該變體與一種不尋常的兒童皮質性白內障表型共分離。SHH對晶狀體形成很重要,其受體(PTCH1)的突變導致綜合征性白內障。我們的數據表明,主要在發(fā)育中的眼組織中,一種對SHH表達重要的增強子的功能增強。