【佳學基因檢測】基因檢測如何改善三陰性乳腺癌的治療方案
乳腺癌不同亞型的基因檢測導讀:
《乳腺癌不同亞型的基因檢測對治療的幫助作用》總結了現(xiàn)有的治療方案、治療藥物及其在治療三陰性乳腺癌患者中的療效,并討論了一些新的臨床前研究和靶向治療方案,旨在為三陰性乳腺癌治療方案和靶點提供新的思路和方向。
基因檢測明確三陰型乳腺癌后的治療方案:
《乳腺癌基于基因檢測結果的個性化治療》通過對對587例三陰性乳腺癌患者的腫瘤樣本進行了基因表達譜分析,并將三陰性乳腺癌分為六個亞型:基底樣1型(BL1)、基底樣2型(BL2)、間充質型(M)、間充質干細胞樣(MSL)、免疫調節(jié)(IM)和管腔雄激素受體(LAR)。致病基因鑒定基因解碼研究人員還進行了基因分析,比較了現(xiàn)有的三陰性乳腺癌乳腺癌細胞系,將三陰性乳腺癌細胞分為六種不同的亞型,從而為三陰性乳腺癌的臨床治療提供了一個正確的細胞模型。
三陰型乳腺癌的基因檢測分型及其個性化治療方案
TNBC亞型 | 遺傳異常 | 細胞系 | 亞型相關性(p值) | 組織學 | 基因檢測結果 |
基底樣1型 | 細胞周期基因表達 | HCC2157 | 0.66 (0.00) | DC | BRCA1; STAT4; UTX |
DNA修復基因(ATR-BRCA途徑) | HCC1599 | 0.62 (0.00) | DC | BRCA2; TP53; CTNND1; TOP2B; CAMK1G | |
增殖基因 | HCC1937 | 0.28 (0.00) | DC | BRCA1; TP53; MAPK13; MDC1 | |
HCC1143 | 0.26 (0.00) | IDC | TP53 | ||
HCC3153 | 0.24 (0.00) | DC | BRCA1 | ||
MDA-MB-468 | 0.19 (0.06) | DC | PTEN; RB1; SMAD4; TP53 | ||
HCC38 | 0.19 (0.01) | CDKN2A; TP53 | |||
基底樣2型 | 生長因子信號通路(EGFR、MET、NGF、Wnt/β-連環(huán)蛋白、IGF-1R) | SUM149PT | 0.30 (0.00) | INF | BRCA1 |
糖酵解,糖異生 | CAL-851 | 0.25 (0.00) | IGA | RB1; TP53 | |
肌上皮標志物的表達 | HCC70 | 0.24 (0.04) | DC | PTEN; TP53 | |
HCC1806 | 0.22 (0.00) | ASCC | CDKN2A; TP53; UTX | ||
HDQ-P1 | 0.18 (0.17) | IDC | TP53 | ||
免疫調節(jié)型 | 髓質BC(預后良好的罕見TNBC)的免疫細胞過程(CTLA4、IL2、IL7途徑、抗原處理/呈遞)基因特征 | HCC1187 | 0.22 (0.00) | DC | TP53; CTNNA1; DDX18; HUWE1; NFKBIA |
DU4475 | 0.17 (0.00) | DC | APC; BRAF; MAP 2 K4; RB1 | ||
間充質型 | 細胞運動 | BT-549 | 0.21 (0.00) | IDC | PTEN; RB1; TP53 |
細胞分化 | CAL-51 | 0.17 (0.00) | AC | PIK3CA | |
生長因子信號傳導 | CAL-120 | 0.09 (0.00) | AC | TP53 | |
急診室 | |||||
間充質干細胞型 | 類似于M+ | HS578T | 0.29 (0.00) | CS | CDKN2A; HRAS; TP53 |
低增殖 | MDA-MB-157 | 0.25 (0.00) | MBC | NF1; TP53 | |
血管生成基因 | SUM159PT | 0.14 (0.00) | ANC | PIK3CA; TP53 HRAS | |
MDA-MB-436 | 0.13 (0.00) | IDC | BRCA1; TP53 | ||
MDA-MB-231 | 0.12 (0.00) | IDC | BRAF; CDKN2A; KRAS; NF2; TP53; PDGFRA | ||
管腔雄激素受體 | 雄激素受體基因 | MDA-MB-453 | 0.53 (0.00) | AC | PIK3CA; CDH1; PTEN |
管腔基因表達模式 | SUM185PE | 0.39 (0.00) | DC | PIK3CA | |
分子頂分泌亞型 | HCC2185 | 0.34 (0.00) | AC | PIK3CA | |
CAL-148 | 0.32(0.00) | AC | PIK3CA; RB1; TP53; PTEN | ||
MFM-223 | 0.31 (0.00) | PIK3CA; TP53 |
《腫瘤850基因檢測》的大數據統(tǒng)計結果顯示三陰性乳腺癌腫瘤樣本的基因表達譜分析發(fā)現(xiàn)基底樣1型,即BL1亞型中細胞周期調節(jié)和DNA修復相關基因的異常表達,這些基因包括MYC、PIK3CA、CDK6、AKT2、KRAS、FGFR1、IGF1R、CCNE1和CDKN2A/B的高擴增,以及BRCA2、PTEN、MDM2、RB1和TP53等DNA修復相關基因的高雜合或純合缺失)。三陰性乳腺癌中的基底樣1型可能的治療藥物包括聚ADP核糖聚合酶(PARP)抑制劑和基因毒性藥物。三陰性乳腺癌中的基底樣1型。三陰性乳腺癌中的基底樣2型(BL2亞型)具有信號通路的異常激活,如EGFR、MET、NGF、Wnt/β-連環(huán)蛋白和IGF-1R通路,潛在的靶向治療藥物包括mTOR抑制劑和生長因子抑制劑(拉帕替尼、吉非替尼和西妥昔單抗)。
三陰性乳腺癌中的間充質型(M亞型)具有高度激活的細胞遷移相關信號通路(由肌動蛋白調節(jié))、細胞外基質-受體相互作用通路和分化通路(Wnt通路、間變性淋巴瘤激酶通路、轉化生長因子(TGF)-β信號),因此也被稱為化生性乳腺癌。三陰性乳腺癌中的間充質型(M亞型)具有肉瘤樣或鱗狀上皮細胞樣組織特征,易對化療藥物產生耐藥性。因此,三陰性乳腺癌中的間充質型患者者可以使用mTOR抑制劑或靶向上皮-間質轉化的藥物治療。
與M亞型相比,三陰性乳腺癌中的間充質干細胞亞型表達低水平的細胞增殖相關基因和高水平的干細胞相關基因,這些基因包括ABCA8、PRORC、ENG、ALDHA1、PER1、ABCB1、TERT2IP、BCL2、BMP2和THY、HOX基因(HOXA5、HOXA10、MES1、MES2、MEOX1、MEOX2和MSX1)和間充質干細胞特異性標記物(BMP2、ENG、ITGAV、KDR、NGFR、NT5E、PDGFR、THY1和VCAM1)。三陰性乳腺癌中的間充質干細胞亞型的基因解碼暗示患者可能接受PI3K抑制劑、Src拮抗劑或抗血管生成藥物治療?;蚪獯a研究還表表明,一種Abl/Src抑制劑達沙替尼可用于治療M型和MSL型乳腺癌患者。
IM亞型顯著豐富了免疫細胞相關基因和信號轉導途徑,如Th1/Th2途徑、NK細胞途徑、B細胞受體信號途徑、樹突狀細胞(DC)途徑、T細胞受體信號途徑、白細胞介素(IL)-12途徑和IL-7途徑。具有基因解碼能力的臨床大夫考慮,IM亞型與乳腺髓樣癌高度相似。建議使用PD1、PDL1、CTLA-4和其他免疫檢查點抑制劑治療IM亞型乳腺癌患者。
LAR亞型的基因表達譜與其他TNBC亞型顯著不同。盡管LAR亞型不表達ER受體,但它確實具有高度激活的激素相關信號通路(包括類固醇合成、卟啉代謝和雄激素/雌激素代謝)。值得注意的是,雄激素受體(AR)在LAR亞型乳腺癌中高度表達,其mRNA水平是其他TNBC亞型的9倍。免疫組織化學還檢測AR的高表達,以及大量AR下游代謝標記物及其輔助激活劑(DHCR24、ALCAM、FASN、FKBP5、APOD、PIP、SPDEF和CLDN8)在LAR亞型中的表達。以腫瘤的發(fā)生與惡變機理做為分析基礎的基因解碼建議LAR亞型乳腺癌患者進行抗AR治療。
(責任編輯:佳學基因)