【佳學基因檢測】綜合 miRNA 序列分析揭示彌漫性大 B 細胞淋巴瘤患者的生存差異

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數(shù)據(jù)分析腫瘤基因檢測位點的全面性與正確性《腫瘤個性治療的方法與措施》《Nature》在2020 Oct; 586(7831): 763–768.發(fā)表了一篇題目為《綜合 miRNA 序列分析揭示彌漫性大 B 細胞淋巴瘤患者的生存差異》腫瘤靶向藥物治療基因檢測臨床研究文章。該研究由Alexander G. Bick,? Joshua S. Weinstock, Satish K. Nandakumar, Charles P. Fulco, Erik L. Bao, Seyedeh M. Zekavat, Mindy D. Szeto, Xiaotian Liao, Matthew J. Leventhal, Joseph Nasser, Kyle Chang, Cecelia Laurie, Bala Bharathi Burugula, Christopher J. Gibson, Amy E. Lin, Margaret A. Taub, Francois Aguet, Kristin Ardlie, Braxton D. Mitchell, Kathleen C. Barnes, Arden Moscati, Myriam Fornage, Susan Redline, Bruce M. Psaty, Edwin K. Silverman, Scott T. Weiss, Nicholette D. Palmer, Ramachandran S. Vasan, Esteban G. Burchard, Sharon L. R. Kardia, Jiang He, Robert C. Kaplan, Nicholas L. Smith, Donna K. Arnett, David A. Schwartz, Adolfo Correa, Mariza de Andrade, Xiuqing Guo, Barbara A. Konkle, Brian Custer, Juan M. Peralta, Hongsheng Gui, Deborah A. Meyers, Stephen T. McGarvey, Ida Yii-Der. Chen, M. Benjamin Shoemaker, Patricia A. Peyser, Jai G. Broome, Stephanie M. Gogarten, Fei Fei Wang, Quenna Wong, May E. Montasser, Michelle Daya, Eimear E. Kenny, Kari E. North, Lenore J. Launer, Brian E. Cade, Joshua C. Bis, Michael H. Cho, Jessica Lasky-Su, Donald W. Bowden, L. Adrienne. Cupples, Angel C. Mak, Lewis C. Becker, Jennifer A. Smith, Tanika N. Kelly, Stella Aslibekyan, Susan R. Heckbert, Hemant K. Tiwari, Ivana V. Yang, John A. Heit, Steven Lubitz, Jill M. Johnsen, Joanne E. Curran, Sally E. Wenzel, Daniel E. Weeks, Dabeeru C. Rao, Dawood Darbar, Jee-Young Moon, Russell P. Tracy, Erin J. Buth, Nicholas Rafaels, Ruth J.F. Loos, Peter Durda, Yongmei Liu, Lifang Hou, Jiwon Lee, Priyadarshini Kachroo, Barry I. Freedman, Daniel Levy, Lawrence F. Bielak, James E. Hixson, James S. Floyd, Eric A. Whitsel, Patrick T. Ellinor, Marguerite R. Irvin, Tasha E. Fingerlin, Laura M. Raffield, Sebastian M. Armasu, Marsha M. Wheeler, Ester C. Sabino, John Blangero, L. Keoki Williams, Bruce D. Levy, Wayne Huey-Herng Sheu, Dan M. Roden, Eric Boerwinkle, JoAnn E. Manson, Rasika A. Mathias, Pinkal Desai, Kent D. Taylor, Andrew D. Johnson, NHLBI Trans-Omics for Precision Medicine Consortium, Paul L. Auer, Charles Kooperberg, Cathy C. Laurie, Thomas W. Blackwell, Albert V. Smith, Hongyu Zhao, Ethan Lange, Leslie Lange, Stephen S. Rich, Jerome I. Rotter, James G. Wilson, Paul Scheet, Jacob O. Kitzman, Eric S. Lander, Jesse M. Engreitz, Benjamin L. Ebert, Alexander P. Reiner, Siddhartha Jaiswal, Gon?alo Abecasis, Vijay G. Sankaran, Sekar Kathiresan, and Pradeep Natarajan,等完成。促進了腫瘤的正確治療與個性化用藥的發(fā)展，進一步強調(diào)了基因信息檢測與分析的重要性。

腫瘤靶向藥物及正確治療臨床研究內(nèi)容關鍵詞：

彌漫性大 B 細胞淋巴瘤,DLBCL,microRNAs,miRNAs,石蠟包埋組織,國際預后指數(shù)評分,淋巴瘤形成。

腫瘤靶向治療基因檢測臨床應用結果

背景：彌漫性大 B 細胞淋巴瘤 (DLBCL) 是一種侵襲性疾病，30% 至 40% 的患者無法通過可用的主要治療治好。 microRNA (miRNA) 是減弱其 mRNA 靶標表達的 RNA 分子。為了表征 DLBCL miRNome，我們對來自 92 個 DLBCL 和 15 個良性中心母細胞新鮮冷凍樣品以及來自 140 個 DLBCL 福爾馬林固定、石蠟包埋的組織樣品的 miRNA 進行了測序以進行驗證。結果：我們鑒定了已知和候選的新 miRNA，其中 25 個相關生存獨立于細胞來源和國際預后指數(shù)評分，這是既定的結果指標。在這 25 種 miRNA 中，有 6 種 miRNA 在我們的驗證隊列中與存活率顯著相關。 miR-28-5p、miR-214-5p、miR-339-3p 和 miR-5586-5p 的大量表達與優(yōu)越的結果相關，而 miR-324-5p 和 NOVELM00203M 的大量表達與較差的結果相關。將 DLBCL miRNA-seq 表達譜與其他癌癥類型的表達譜進行比較，確定了在 B 細胞環(huán)境中更豐富的 miRNA。 miRNA 的無監(jiān)督聚類確定了兩組患者的結果有明顯差異。我們的綜合 miRNA 和 mRNA 表達分析表明，DLBCL 中豐富的 miRNA 似乎可以調(diào)節(jié)參與代謝、細胞周期和蛋白質修飾的基因的表達。此外，這些 miRNA，包括一種候選新 miRNA，miR-10393-3p，似乎靶向染色質修飾基因，這些基因是非霍奇金淋巴瘤中體細胞突變的常見靶標。結論我們對 DLBCL mirNome 的全面序列分析確定了候選新 miRNA 和 miRNA與生存相關，加強了先前突變分析的結果，并揭示了對淋巴瘤發(fā)生具有重要意義的調(diào)控網(wǎng)絡。

腫瘤發(fā)生與反復轉移國際數(shù)據(jù)庫描述：

Diffuse large B-cell lymphoma,DLBCL,microRNAs, miRNAs,paraffin-embedded tissue,International Prognostic Index scores,lymphomagenesis.