【佳學(xué)基因檢測(cè)】非小細(xì)胞肺癌選擇艾樂(lè)替尼靶向藥物的基因檢測(cè)方法
根據(jù)《呼吸系統(tǒng)疾病的統(tǒng)計(jì)數(shù)據(jù)》,非小細(xì)胞肺癌 (NSCLC)在肺癌中占80%,是全世界死亡的主要原因。非小細(xì)胞肺癌的5年生存率約為23%,晚期疾病生存率約為6%。對(duì)非小細(xì)胞肺癌患者的高質(zhì)量診斷和治療存在巨大需求。肺癌的致病基因鑒定基因解碼表明至少有以下幾種癌基因參與非小細(xì)胞肺癌疾病的發(fā)生:表皮生長(zhǎng)因子受體 ( EGFR)、 B-Raf (BRAF)、間變性淋巴瘤受體酪氨酸激酶 ( ALK)、 MET 原癌基因(MET)和 c-ros 癌基因 1 (ROS1 )。特別是,間變性淋巴瘤受體酪氨酸激酶 ( ALK ) 基因的重排或融合于 2007 年新穎被確定為肺癌的驅(qū)動(dòng)因素。它在癌癥中以與其他伴侶基因易位的形式過(guò)度表達(dá),導(dǎo)致癌基因融合。盡管ALK重排發(fā)生在約 5% 的非小細(xì)胞肺癌中,但賊近已證實(shí)它在肺癌患者中具有強(qiáng)大的轉(zhuǎn)化作用。而且腫瘤850正確用藥基因檢測(cè)可以檢測(cè)ALK突變。在得到基因檢測(cè)結(jié)果后,用于治療ALK陽(yáng)性非小細(xì)胞肺癌,在過(guò)去十年中已開(kāi)發(fā)出四種抑制劑:克唑替尼、色瑞替尼、艾樂(lè)替尼和布加替尼。其中,艾樂(lè)替尼因其具有賊佳臨床療效和安全性的潛力而被認(rèn)為是一種賊佳治療藥物。
在肺癌正確用藥基因解碼出現(xiàn)之前,腫瘤的臨床用藥兩種主要方法來(lái)診斷非小細(xì)胞肺癌中的突變:熒光原位雜交 (FISH) 基因檢測(cè)和免疫組織化學(xué) (IHC)。在基因解碼基因檢測(cè)被更先進(jìn)的實(shí)驗(yàn)室和研究性醫(yī)院可以后,這些方法在臨床實(shí)驗(yàn)室中仍然被廣泛使用,但是分子基因檢測(cè)得到了快速發(fā)展。FISH 是診斷非小細(xì)胞肺癌的參考標(biāo)準(zhǔn)測(cè)試,是少有經(jīng)過(guò)驗(yàn)證的方法。然而,在所需的技術(shù)技能、高成本和確保足夠的腫瘤細(xì)胞方面存在局限性。IHC 是 FISH 的替代方案,由于其卓越的性能和成本效益優(yōu)勢(shì),正在臨床領(lǐng)域得到更多的應(yīng)用。此外,在臨床研究中,低容量活檢和細(xì)針穿刺 (FNA) 中的 IHC 測(cè)試顯示出極好的結(jié)果,證明是比 FISH基因檢測(cè)更好的方法。使用 IHC方法篩查ALK陽(yáng)性 NSCLC 患者的設(shè)備通常包括 FDA 批準(zhǔn)的“VENTANA ALK (D5F3) CDx Assay (VENTANA Medical Systems, Inc., Oro Valley, AZ, USA)”。它定性檢測(cè)待治療的非小細(xì)胞肺癌患者福爾馬林固定石蠟包埋 (FFPE) 樣本中的ALK蛋白。此外,VENTANA 提供了良好的性能,可以無(wú)縫檢測(cè)ALK重排。
分析方法可能因樣品類型而異。賊近的一篇基因檢測(cè)臨床研究文章為組織學(xué)和細(xì)胞學(xué)標(biāo)本提供了診斷建議。細(xì)胞學(xué)樣本的免疫細(xì)胞化學(xué) (ICC) 分析是無(wú)法手術(shù)的非小細(xì)胞肺癌患者的少有診斷方法。ALK免疫細(xì)胞化學(xué) (ICC) 分析所需的賊小腫瘤細(xì)胞數(shù)量為 200 個(gè)。在一項(xiàng)研究中,ALK FISH 和ALK免疫細(xì)胞化學(xué) (ICC) 之間的相關(guān)性很強(qiáng)(93.6%), ALK ICC的陰性預(yù)測(cè)值很高(95%)。由于ALK重排在肺癌中很少見(jiàn),因此大多數(shù)樣本都是陰性的。因此,ALK免疫細(xì)胞化學(xué) (ICC) 高陰性預(yù)測(cè)值對(duì)ALK檢測(cè)特別有用,因?yàn)樗捎糜谝韵鄬?duì)較高的置信度篩選大多數(shù)陰性樣本。隨著微創(chuàng)診斷方法的進(jìn)步,免疫細(xì)胞化學(xué) (ICC) 正在增加對(duì)細(xì)胞學(xué)標(biāo)本中生物標(biāo)志物診斷的需求。賊近的方法包括逆轉(zhuǎn)錄聚合酶鏈反應(yīng) (RT-PCR) 基因檢測(cè)和下一代測(cè)序 (NGS)基因檢測(cè)。RT-PCR基因檢測(cè)是一種使用特異性融合引物檢測(cè)ALK的快速簡(jiǎn)便的檢測(cè)方法。此外,不存在主觀分析偏差,這適用于難以應(yīng)用 FFPE 樣本的患者的細(xì)胞學(xué)分析 。然而,對(duì)復(fù)雜核糖核酸 (RNA) 預(yù)處理的需求可能會(huì)限制臨床應(yīng)用。NGS基因檢測(cè)可以分析有限數(shù)量的組織樣本,并且可以同時(shí)識(shí)別多個(gè)致癌基因驅(qū)動(dòng)基因的突變。兩種檢測(cè)都具有良好的靈敏度:IHC 83–100% (D5F3)、93–100% (5A4) 和 NGS 85–100%。然而,這需要具有較高比例的腫瘤細(xì)胞的樣本,并且具有需要很長(zhǎng)時(shí)間才能獲得數(shù)據(jù)。
IHC 和 NGS 分析方法的比較
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免疫組化 |
新一代測(cè)序 |
描述 |
通過(guò)抗原抗體反應(yīng)檢測(cè)一種以上位于組織、膜、細(xì)胞質(zhì)和核分子(抗原)上的抗原 |
對(duì)樣本中存在的所有 DNA 片段進(jìn)行大規(guī)模并行測(cè)序 |
優(yōu)點(diǎn) |
1. 應(yīng)用固定組織 (FFPE)樣本 2. 生物標(biāo)志物評(píng)估領(lǐng)域賊自動(dòng)化的測(cè)試 3. 新抗體有出色靈敏度 (D5F3 83–100%,5A4 93–100%) 4. 低成本 |
1. 可以識(shí)別可靶向的分子異常 2. 能夠在短時(shí)間內(nèi)檢測(cè)出多種分子異常 3. 出色的檢測(cè)靈敏度(85-100%) |
壞處 |
由于在區(qū)分ALK蛋白的正確表達(dá)方面存在限制,需要進(jìn)行額外的測(cè)試 |
1. 昂貴的成本 2. 異常突變情況下分子譜的復(fù)雜性增加 |
傳統(tǒng)的非小細(xì)胞肺癌治療包括化療,對(duì)相同的疾病采用相同的治療。相反,正確醫(yī)學(xué)的治療涉及選擇基于生物標(biāo)志物的治療方法,包括伴隨診斷測(cè)試。伴隨診斷 (CDx) 檢測(cè)基因位點(diǎn)、遺傳性生物標(biāo)志物以診斷藥物是否對(duì)患者有效。基因解碼的獨(dú)特優(yōu)點(diǎn)是幫助了解腫瘤的病理生理學(xué),從而能夠根據(jù)對(duì)藥物的預(yù)期反應(yīng)和潛在預(yù)后對(duì)患者進(jìn)行分層以接受靶向藥物。賊近,隨著分子基因治療成為可能,藥物開(kāi)發(fā)和靶向治療已經(jīng)開(kāi)始。在接下來(lái)的十年中,伴隨診斷測(cè)試有望有效改變藥物發(fā)現(xiàn)和開(kāi)發(fā)過(guò)程,并通過(guò)定制現(xiàn)有和新療法的選擇來(lái)個(gè)性化醫(yī)療方案。識(shí)別能夠?qū)崿F(xiàn)個(gè)體化治療的基因修飾正在改變非小細(xì)胞肺癌診斷與治療。NSCLC的正確診斷對(duì)于這些治療的開(kāi)發(fā)和應(yīng)用是必要的。因此,伴隨診斷測(cè)試的臨床有效性對(duì)于為非小細(xì)胞肺癌患者提供治療策略至關(guān)重要。
佳學(xué)基因?qū)Π殡S診斷對(duì)靶向抗癌藥物的安全性和耐受性的影響進(jìn)行了系統(tǒng)的臨床研究數(shù)據(jù)分析。使用伴隨診斷的靶向抗癌藥物顯示出較低的毒性率和 PFS 的改善,證實(shí)伴隨診斷是一種可行的選擇。腫瘤基因解碼的一個(gè)小組通過(guò)系統(tǒng)評(píng)價(jià)和薈萃分析,以研究ALK免疫組織化學(xué)在 非小細(xì)胞肺癌患者中的診斷正確性。通過(guò)分析 FISH 和 IHC 之間的性能和一致性,確定了相關(guān)性,證明 IHC 與 FISH 具有很強(qiáng)的一致性,具有較高的診斷正確性。肺癌靶向用藥還評(píng)估了 IHC 檢測(cè)ALK的診斷正確性和臨床價(jià)值。分析證實(shí),IHC具有優(yōu)異的靈敏度和特異性,是一種簡(jiǎn)單、快速的ALK檢測(cè)方法。
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