【佳學基因檢測】科研服務(wù):RNAseq基因檢測中的SRA數(shù)據(jù)獲取
大規(guī)模高通量RNAseq基因測序基因檢測中的數(shù)據(jù)獲?。?/h2>
RNAseq數(shù)據(jù)數(shù)據(jù)庫，根據(jù)佳學基因的基因信息數(shù)據(jù)庫構(gòu)建標準這是一類大量存儲RNA測序數(shù)據(jù)的資料庫，英語常被稱為Sequence Read Archive, 大量機構(gòu)將其翻譯為序列讀取檔案庫。但是作為一家根植于中國市場的基因信息科技機構(gòu)，佳學基因采用RNAseq測序數(shù)據(jù)庫。從RNASeq數(shù)據(jù)庫（SRA)中，獲取人類組織的序列，以及用來驗證、增強證據(jù)的實驗?zāi)Ｐ蛣游镄⌒∈蟮男蛄羞M行分析。在分析過程中，佳學基因選擇采用華大智造或者是Illumina RNA seq的測序列批量或全轉(zhuǎn)錄本單細胞測序數(shù)據(jù)分析。佳學基因采用Entrez API獲得的NCBI SRA元數(shù)據(jù)中解析并運行SRA的元數(shù)據(jù)（參見佳學基因：SRA數(shù)據(jù)集的選擇）。對于GTEXV8，佳學基因從SRA和國家云計算云平臺獲得序列數(shù)據(jù)，從GTEXPortal的注釋部分獲得元數(shù)據(jù)。對于TCGA，佳學基因使用GDC下載客戶端工具獲得了測序數(shù)據(jù)，并從早期的運行軟件中再次使用經(jīng)過整理的元數(shù)據(jù)。
