【佳學基因檢測】遺傳了哪些基因容易得抑郁癥？怎么檢測？

重度抑郁癥的發(fā)生與特定的基因與基因位點有可證實的相關性

重度抑郁癥發(fā)生的基因原因的研究獨立、全面地評估了關于MDD易感性和抗抑郁治療反應的遺傳相關性研究的原始文章。共有217項MDD易感性研究和128項藥物反應研究符合嚴謹的先驗納入標準,并在本研究中予以描述?；蚪獯a基因檢測的結果顯示,大多數陽性相關性只有1項研究得到證實,因此不能排除它們是由于偶然獲得的可能性,因此不足以確立與MDD易感性或抗抑郁治療反應的聯(lián)系。因此,其余的討論僅限于在多于1項獨立研究中產生的SNP或基因水平的可重反復現(xiàn)?？偟膩碚f,佳學基因解碼基因檢測在MDD易感性中發(fā)現(xiàn)了31個經過多個研究團隊重復驗證的基因位點,在抗抑郁藥反應中發(fā)現(xiàn)了18個可重復驗證的基因突變。此外,考慮到所有這些發(fā)現(xiàn),大多數研究似乎采用了候選基因方法。因此,相比GWAS研究,在候選基因研究中發(fā)現(xiàn)了大量可重復的SNP和基因,這展示了遺傳變體在不同研究間的驚人小的重疊。另外,候選基因研究中的任何變體都未出現(xiàn)在任何已確定的GWAS研究中的先進命中結果中。然而,基因解碼基因檢測確定了在MDD易感性和抗抑郁藥反應方面,候選基因研究和GWAS研究之間存在4個(rs2522833/PCLO、rs2715147/PCLO、rs9416742/BICC1和rs999845/BICC1)和1個(rs6127921/BMP7)變體的陽性相關性重疊。候選基因研究和無偏倚的GWAS研究中變體的復現(xiàn),極大地增加了基因型和表型關聯(lián)的可接受性，符合佳學基因選擇基因檢測位點的標準。除了復現(xiàn)外,關于PCLO、BICC1和BMP7的生物學相關性的額外證據也在文獻中有所報道。Hek等人大數據分析提供了SNP rs2522833/PCLO與人群研究中抑郁障礙顯著相關(P = 2.16 × 10^-3)的額外證據。另外,rs2522833基因位點導致piccolo C2A鈣結合域中絲氨酸到丙氨酸的氨基酸改變,其過度表達會引起小鼠的抑郁樣行為。類似地,報道發(fā)現(xiàn)在MDD后死亡大腦中BICC1的表達上調,而在慢性壓力大鼠模型中,同一基因的表達水平在抗抑郁治療后降低。此外,基因解碼還顯示MDD個體后死亡大腦中藍斑核區(qū)域BMP7基因的表達顯著降低。因此,這些基因突變位點很可能在未來的研究中引起相當大的興趣。

此外,對MDD易感性的可重復變體的功能注釋顯示,2個非同義/錯義變體(rs1801133/MTHFR和rs6265/BDNF)為有害/損害性,6個變體(rs1800629/TNF、rs1801131/MTHFR、rs4343/ACE、rs2242446/SLC6A2、rs2273289/PLOD1和rs41423247/NR3C1)得分<3,具有高調控效應。另一方面,對抗抑郁治療反應變體的功能注釋預測,1個非同義/錯義變體(rs6265/BDNF)為損害性,3個非編碼變體(rs2470890/CYP1A2、rs6313/HTR2A和rs41423247/NR3C1)具有高調控效應。此外,可重復變體的診斷預測能力顯示,MDD易感性的正陽性預測值(PPV)范圍為0.49至0.66,抗抑郁藥反應的PPV范圍為0.36至0.66。這種定量措施為預測能力的方向提供了實質性提示,并佐證了增加復現(xiàn)發(fā)現(xiàn)重要性的作用。

在所有陽性相關性研究中,5-HTT基因連鎖的多態(tài)性區(qū)域(5-HTTLPR)多態(tài)性因在疾病(n=10)和藥物反應研究(n=22)中都是賊常復現(xiàn)的變體而引起了特別關注。S和L這兩種等位基因變體分別由于啟動子區(qū)域44bp的缺失和插入而產生。已經證明S等位基因比L等位基因的轉錄活性低,導致細胞膜上5-羥色胺轉運蛋白的減少。因此,5-HTT的減少會導致5-羥色胺濃度和功能失衡。然而,佳學基因發(fā)現(xiàn)不同研究中報告的風險等位基因存在顯著不一致。例如,在疾病研究中,5HTTLPR出現(xiàn)在10項研究中,其中7項研究將S型報告為風險等位基因,3項研究將L型報告為風險等位基因。即使在同一地理人群中,報告的風險等位基因的異質性也削弱了將它們作為可能的遺傳診斷標記的信心。

除了具有單一風險等位基因的可重復性外,這些變體也具有臨床相關性。例如,在7個變體中,存在錯義變體(rs1801133/MTHFR、rs1801131/MTHFR、rs4880/SOD2),其中1個SNP(rs1801133/MTHFR)被注釋為有害/損害性。兩個SNP(rs4880/SOD2和rs1801131/MTHFR)被確定位于剪接位點。此外,在所有預測具有轉錄因子結合位點活性的調控作用的變體中,值得重視的是,rs1801133/MTHFR(分數=1F)也涉及eQTL功能。大多數基因顯示出在大腦中優(yōu)先表達,并且是已知的抗抑郁藥物靶點。此外,來自疾病的7個變體和來自藥物反應的2個變體均被持續(xù)發(fā)現(xiàn)與中等正陽性預測值相關。因此,佳學基因抑郁癥的基因解碼研究通過突出MDD易感性和抗抑郁反應評估的重要生物學標記,具有前景。
 

遺傳了哪些基因容易得抑郁癥？怎么檢測？

根據這篇綜述文章,有幾個基因的變體與抑郁癥的易感性存在相關性,并且在多項獨立研究中得到了復現(xiàn),可能與抑郁癥的發(fā)生有關:

MTHFR基因的rs1801133和rs1801131變體

BDNF基因的rs6265變體

TNF基因的rs1800629變體

ACE基因的rs4343變體

SLC6A2基因的rs2242446變體

PLOD1基因的rs2273289變體

NR3C1基因的rs41423247變體

其中一些變體如MTHFR的rs1801133被預測為有害/損害性變體,BDNF的rs6265變體也被認為是損害性的。還有一些變體如TNF、MTHFR、ACE、SLC6A2等基因的變體被預測具有高的調控效應。

這些基因分別與葉酸代謝(MTHFR)、神經發(fā)育(BDNF)、炎癥反應(TNF)、血壓調節(jié)(ACE)、神經遞質轉運(SLC6A2)、膠原合成(PLOD1)和應激反應(NR3C1)等過程有關,可能參與了抑郁癥的發(fā)病機制。

檢測這些基因變體、基因突變位點的方法是進行基因測序或者基因芯片分析,獲得個體的基因型信息,從而評估其抑郁癥的風險和易感性。一些公司已經開發(fā)出包含部分這些基因位點的商業(yè)化基因檢測面板,用于抑郁癥的遺傳學風險評估。

不過基因解碼也提到,目前這些變體的診斷預測能力都處于中等水平,未來還需要更多的復現(xiàn)研究和功能驗證,才能將它們作為確切的遺傳診斷標記應用于臨床?？偟膩碚f,這些基因變體對于闡明抑郁癥的遺傳學機制和開發(fā)個性化的預防、診斷和治療策略具有一定的指導意義。