【佳學基因檢測】哪里可以作單細胞RNA測序（scRNAseq）科研服務？

佳學基因科研合作導讀：

在生物醫(yī)學技術的發(fā)展過程中，高通量測序方法結合基因解碼技術有效改變了整個生物學領域。采用RNA測序技術（RNA seq)給我們以非常詳細地研究整個轉(zhuǎn)錄組的機會，產(chǎn)生了許多重要的發(fā)現(xiàn)，目前，它已經(jīng)成為一個生物醫(yī)學研究的常規(guī)方法。然而過去的RNA測序主要是將一個組織的細胞做為一個整體來進行的，獲得的轉(zhuǎn)錄序列實際上是整個實驗樣本從數(shù)千到數(shù)百萬個細胞的基因表達情況的總體呈現(xiàn)，這種方法可能抹除了一個群體內(nèi)不同細胞生物學功能、及生物學過程的差異。為進一步細化基因解碼過程，單細胞RNAseq測序技術結合基因解碼分析成為一種克服這類問題的方法。通過分離單個細胞、獲取單個細胞的轉(zhuǎn)錄本、在單細胞水平上制做單細胞測序文庫，scRNA-seq可以以產(chǎn)前所未有的分辨率來評估細胞群體之間、細胞群體內(nèi)部以及細胞總體之間的生物學的特性差異。佳學基因為這一過程的順利高效進行，開發(fā)了單細胞測序?qū)嶒灧桨讣皵?shù)據(jù)分析和展現(xiàn)流程。以幫助佳學基因科研合作伙伴在科研項目進行的各個階段提前做好規(guī)劃和設計。佳學基因也可以在不同階段參與規(guī)劃、設計和執(zhí)行。

單細胞測序?qū)ёx：

根據(jù)《人體基因信息測序技術大全》，“轉(zhuǎn)錄組”是指細胞、組織或生物體內(nèi)全部轉(zhuǎn)錄本的總合。結合生物學、醫(yī)學及臨床診斷的需要。其全部含義應包括全部表達出來的基因序列及其對應的生理功能和組織狀態(tài)。因此，一個優(yōu)質(zhì)的轉(zhuǎn)錄本測序不僅包括正確全面的獲得轉(zhuǎn)錄本的序列，更主要的是將這種基因序列同已知及未知的生物學醫(yī)學功能狀態(tài)結合起來。目前，這實際上是由兩個技術體系精密配合下才得以完成。即測序技術和基因解碼技術。轉(zhuǎn)錄組包括蛋白質(zhì)編碼信使RNA（mRNA）以及核糖體功能的重要參與者，這里是指核糖體RNA（rRNA)、轉(zhuǎn)移RNA(tRNA）和具有調(diào)節(jié)功能的非編碼RNA。根據(jù)《人體基因序列與人體疾病表征》，這三者的功能是相互交織的。部分mRNA序列也行使著調(diào)節(jié)RNA的功能。2005年高通量測序技術的出現(xiàn)使得佳學基因及其合作研究機構可以在核苷酸水平上分析RNA，從而對轉(zhuǎn)錄組進行詳細研究。

批量RNA測序（RNA seq）是采用勻漿組織對大群細胞中提取的RNA進行的。佳學基因采用這一技術可以分析基因的組織及時空特異性表達、腫瘤組織及發(fā)育過程中選擇性剪接的存在、變異的發(fā)現(xiàn)和由基因組重排引起的嵌合基因融合的檢測。然而，由于提取和研究的RNA代表“平均值”，在樣本中存在的數(shù)千到數(shù)百萬個單個細胞轉(zhuǎn)錄組中，細胞之間潛在的重大和生物學上重要的差異被忽視了。佳學基因單細胞轉(zhuǎn)錄本測序分析技術可以為合作者提供因為他人忽視而帶來的創(chuàng)新發(fā)現(xiàn)。

2009年，在高通量測序開始改變生物學領域僅僅四年，單細胞RNA-seq（scRNA-seq）的方案就誕生了。但是那時，分析技術和樣本制備技術還不夠完善。由于，這項技術能夠以前所未有的分辨率研究單個細胞的生物學特性。在第一次scRNA-seq研究中，就對10到100個細胞進行了分析和表征。從那時起，該方法逐漸得到完善和改進。成本降低了，吞吐量提高了，研究社區(qū)現(xiàn)在可以使用幾個商業(yè)平臺。研究人員目前能夠為單個項目分析和排序多達數(shù)萬個單個細胞的轉(zhuǎn)錄組。在這里，我們概述了目前使用的賊常見的scRNA-seq實驗方案以及scRNA-seq數(shù)據(jù)分析的基礎知識。佳學基因還提供了其生物應用以及與新興scRNA-seq技術相關的一些有待解決的問題，為佳學基因的合作伙伴提供進一步貢獻學術研究的機會。賊后，佳學基因為合作研究人員設計課題及研究計劃提供可供模仿和優(yōu)化的scRNA-seq實驗實用指南。

 

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